به گزارش خبرگزاری «حوزه»، متن پیام معظم له به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
جناب مستطاب ملاذ الأنام حجة الإسلام آقای حاج شیخ علی خاتمی، امام جمعه محترم دامت برکاته
خبر رحلت زاهد متقی و بقیة السلف الصالح حجة الإسلام و المسلمین آقای حاج شیخ محمد تقی خاتمی قدّس سرّه موجب تألّم و تأسّف گردید. خدمات ارزشمند آن فقید سعید به مردم شریف این دیار و حوزه علمیه زنجان همواره در خاطر مؤمنان و ارادتمندان و شاگردان ایشان که از خرمن فضل آن عالم خدمتگزار خوشه چینند ماندگار خواهد بود.
این ضایعه مولمه را به جنابعالی و بیت شریف آن مرحوم و عموم مردم دین دار زنجان بویژه شاگردان آن عالم وارسته و حوزه عریق آن سامان تسلیت گفته، از درگاه احدیّت علوّ درجات آن بزرگوار و صبر جمیل و اجر جزیل به خاندان و عموم ارادتمندان آن مرحوم مسألت دارد.
سیّد موسی شبیری زنجانی
17 ربیع الثانی 1436